In dit rapport worden verschillende stalsystemen en mestbewerkingsmethoden geanalyseerd binnen de melkveehouderij, varkenshouderij en kalverhouderij. Hierbij is gekeken naar de reducties van ammoniak- en broeikasgasemissies. Het toepassen van een emissiearme stal heeft in alle gevallen een positief effect op de reductie van ammoniakemissie over de gehele mestketen, maar leidt tot een stijging in investerings- en exploitatiekosten. Voor de akkerbouw zijn dunne fracties economisch aantrekkelijk, terwijl dikke fracties minder besparen maar meer EOS aanvoeren.